Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms