Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms