Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms