Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms