Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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