Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2fQ9CY34 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ube2fQ9CY34 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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