Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms