Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SdhdQ9CXV1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms