Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sgo1Q9CXH7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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