Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Prdm5Q9CXE0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Prdm5Q9CXE0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Prdm5Q9CXE0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Prdm5Q9CXE0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Prdm5Q9CXE0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Prdm5Q9CXE0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prdm5Q9CXE0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm5Q9CXE0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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