Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mgme1Q9CXC3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms