Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufaf1Q9CWX2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms