Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxxc1Q9CWW7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms