Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms