Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms