Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms