Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Fcf1Q9CTH6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Fcf1Q9CTH6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Fcf1Q9CTH6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Fcf1Q9CTH6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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