Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms