Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms