Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CRC3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms