Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl28Q9CR40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms