Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms