Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms