Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atg12Q9CQY1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms