Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PclafQ9CQX4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms