Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms