Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riok2Q9CQS5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms