Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQM1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQM1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms