Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudt21Q9CQF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms