Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms