Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Ubl4bQ9CQ84 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms