Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms