Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700129C05RikQ9CQ77 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms