Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms