Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Use1Q9CQ56 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Use1Q9CQ56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Use1Q9CQ56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Use1Q9CQ56 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Use1Q9CQ56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Use1Q9CQ56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Use1Q9CQ56 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Use1Q9CQ56 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Use1Q9CQ56 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Use1Q9CQ56 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Use1Q9CQ56 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Use1Q9CQ56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Use1Q9CQ56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Use1Q9CQ56 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Use1Q9CQ56 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Use1Q9CQ56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Use1Q9CQ56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Use1Q9CQ56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Use1Q9CQ56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Use1Q9CQ56 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Use1Q9CQ56 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms