Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4921530L21RikQ9CQ47 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms