Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd4Q9CQ02 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms