Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT4

Mydgf, Myeloid-derived growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MydgfQ9CPT4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MydgfQ9CPT4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MydgfQ9CPT4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms