Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Krt88Q9CPR6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt88Q9CPR6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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