Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe41Q99PV5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms