Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt23Q99PS0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt23Q99PS0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt23Q99PS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt23Q99PS0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms