Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms