Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms