Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc4Q99PH1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms