Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms