Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf3Q99P51 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms