Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rims1Q99NE5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms