Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acss1Q99NB1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Acss1Q99NB1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms