Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms