Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms